История открытия ферментов Федеральное государственное образовательное учреждение Высшего профессионального образования "Мурманский государственный технический университет" Кафедра биохимии С.И. Овчинникова ОСНОВЫ ЭНЗИМОЛОГИИ РАЗДЕЛ 1. ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ О ФЕРМЕНТАХ 1.1. Определение ферментов, отличие и сходство ферментов и неорганических катализаторов Ферменты, (от лат. fermentum – закваска), или энзимы (от греч еп – внутри, гуте –закваска) – биологические катализаторы белковой природы, синтезируемые живой клеткой и активирующие биохимические процессы. Русский физиолог И.П. Павлов называл ферменты "возбудителями жизни". В настоящее время известно около 3000 ферментов, более 200 из них получено в кристаллическом состоянии. Ферментология (энзимология) – наука о ферментах и катализируемых ими реакциях. Каждый вид ферментов катализирует превращение определенных веществ (субстратов), иногда — лишь единственного вещества в единственном направлении. Субстрат – соединение, превращение которого катализирует фермент, образуя с ним фермент-субстратный комплекс. Необходимо различать ферменты и неорганические катализаторы. Таблица 1. Различие ферментов и неорганических катализаторов Показатель | Фермент | Неорганические катализаторы | Химическая природа | Биополимер | Низкомолекулярное соединение | Специфичность в отношении субстрата | Высокая | Низкая | Оптимум t | 35...45°С | Более 100°С | Оптимум рН | Физиологический диапазон рН | Сильнокислая или • сильнощелочная среда | Давление | Атмосферное | Выше атмосферного | Увеличение скорости | 108–1011 | 102–106 | Регуляция активности | Генетический контроль | | Сходство между ферментами и катализаторами небиологической природы заключается в том, что они: 1. Не меняют направления реакции. 2. Катализируют энергетически реальные реакции. 3. Не смещают равновесия обратимых процессов. 4. Не расходуются в процессе реакции. Химическая природа ферментов Ферменты – это глобулярные белки. Они подразделяются на однокомпонентные (простые белки) и двухкомпонентные (сложные белки) ферменты. Сложные ферменты называются холоферментами. Белковые компоненты двухкомпонентных ферментов называются апоферментами, небелковые – кофакторами. Последние подразделяются на коферменты и простетические группы. Кофермент – это небелковая часть, лабильно связанная с апоферментом, простетическая группа – небелковая часть, прочно связанная с белком. История открытия ферментов Эликсиры (от араб. аль-иксир – камень мудрости или жизненный сок) были для алхимиков средневековья теми магическими напитками, которые облагораживают "неблагородные" вещества, продлевают жизнь, способны излечить любую болезнь. Эликсиры – ферменты (энзимы) – это биологические катализаторы, без которых не было бы жизни. Они катализируют, управляют и регулируют миллионы химических превращений во всех живых существах. Лишь во взаимодействии с ферментами становятся активными витамины, гормоны и микроэлементы. Многие лечебные средства, такие как сульфамиды и антибиотики, а также ядовитые вещества (например, свинец, ртуть, яды грибов, пестициды и газы нервно-паралитического действия) оказывают свое действие путем торможения функционирования ферментов. Ферменты помогают врачам ставить точные диагнозы. Они успешно используются при лечении нарушений пищеварения, тромбозов, для заживления ран. В пищевой промышленности ферменты используют в пивоварении, производстве сыра, при тендеризации мяса и осветлении фруктовых соков. Дубление кож также "работа" ферментов. В быту ферменты добавляют в моющие средства. С помощью ферментов сегодня производятся миллионы тонн низкокалорийного "сахара", обладающего более сладким вкусом, чем обычный сахар, синтезируются новые виды медикаментов, производятся продукты для диетического питания, а также корма. Успехи генной инженерии стали возможны лишь благодаря использованию ферментов в качестве молекулярных инструментов. Уже в Древнем Египте люди наблюдали и использовали на практике ферментативные реакции, например брожение при варке пива и выпечке хлеба. Пять-шесть тысяч лет тому назад шумеры в Вавилоне также варили пиво. В пивоварнях из муки грубого помола делали караваи, которые слегка запекали, зачем крошили и оставляли для сбраживания. Пивоварение было важным государственным делом. Царь Вавилонии Хаммурапи (1792–1750 гг. до н. э.) в известном своде законов (памятник древневосточного права) постановил, что пивоваров-изготовителей некачественного пива ждет суровая кара: если их уличат в разбавлении пива водой, они будут утоплены в бочках с этим пивом или их заставят пить его до тех пор, пока не наступит смерть. Гомер описал свертывание молока в присутствии млечного сока фигового дерева. Издавна для приготовления сыра использовали сычужный фермент, получаемый из слизистой желудка телят. Великий философ и ученый Аристотель (384–322 гг. до н. э.), сочинения которого охватывают все отрасли современного ему знания, в труде "О возникновении животных" упоминал о сычужном ферменте как о виде молока, образующегося в желудке молодых животных в период их молочного вскармливания. По его мнению, это молоко, содержащее "огонь", который образуется за счет тепла тела животного при свертывании молока. Если заменить слово "огонь" словом "фермент", то это описание Аристотеля будет звучать вполне современно. Изучение ферментов началось лишь в конце XVIII века. Обычно "ферментацией" (от лат. fervere – варить) назывались процессы разложения одного вещества под действием другого; при этом процессы, происходящие с образованием пузырьков углекислого газа, назывались брожением. К первым научным описаниям ферментативных процессов относится описание пищеварения у животных. Рене Антуан Реомюр (1683–1757) при постановке своих экспериментов исходил из предположения о том, что хищные птицы отрыгивают непереваренные остатки пищи. Реомюр сконструировал маленькую проволочную капсулу, в которую был положен кусок мяса. Капсулу с мясом поместил в клетку к сарычу. Через 24 часа сарыч выплюнул эту капсулу. В ней остался размягченный кусок пищи, который, однако, не портился. "Этот процесс может быть только результатом действия какого-то растворителя", – к такому заключению пришел Реомюр. Ладзаро Спалланцани (1729–1799), профессор истории естествознания университета города Падуя, сообщал о подобных экспериментах. Однако он не рассматривал пищеварение как процесс ферментации по той простой причине, что при этом не образовывались пузырьки газа. Более подробно процесс ферментации был изучен одним из основоположников современной химии Антуаном Лораном Лавуазье (1743–1794). Изучая спиртовое брожение, происходящее при изготовлении вина, он обнаружил, что глюкоза превращается в спирт и углекислый газ. К началу XIX века в науке преобладала единая точка зрения: ферментация – это химические изменения, вызываемые некоторыми специфическими формами органического материала, а именно "ферментами". В 1814 г. русский ученый (немец по происхождению), академик Петербургской Академии наук Константин Готлиб Сигизмунд Кирхгоф (1764–1833) показал, что образование сахара из глюкозы в проросших зерновках злаков обусловлено химическим процессом, а не появлением ростков. Несколько лет спустя американский военный врач Уильям Бомонт (1785–1853) подтвердил эксперименты Реомюра и Спалланцани. При лечении пациента с огнестрельным ранением в живот на незаживающей сквозной ране в области желудка ему удалось проанализировать процесс пищеварения различных питательных веществ. Было установлено, что под действием желудочного сока пища может перевариваться и вне живого тела. Бомонт высказал предположение, что наряду с соляной кислотой в желудочном соке содержатся еще и "другие активные химические начала". В 1833 г. Ансель Пайен (1795–1871), директор сахарного завода в Париже, вместе со своим коллегой Жаном Франца Персо (1805–1865) выделили из проросших зерен ячменя "вещество, разжижающее крахмал". При этом они уже тогда обнаружили у этого вещества свойства, которые по современным представлениям относятся к определяющим универсальным свойствам ферментов. Например, относительно небольшие количества препарата могли разжижать большие количества крахмала, однако при нагревании препарат утрачивал эту способность. Активная субстанция могла быть получена в порошкообразном виде из раствора, а после повторного растворения в воде вновь становилась активной. Описанная субстанция, получившая название диастазы (речь идет об амилазе) (от греч. dia – через и stasis – стояние, разделение), была первым растительным ферментом, изученным в очищенном виде в лаборатории. Три года спустя одному из основоположников клеточной теории, немецкому биологу Теодору Шванну (1810–1882) удалось получить в чистом виде и изучить фермент желудочного сока животного происхождения – пепсин. Таким образом, он обнаружил одно из тех "других химических начал", о которых писал Бомонт. Значительно опередил научную мысль своего времени шведский химик Йене Якоб Берцелиус (1779–1848), который утверждал, что ферментативные процессы представляют собой каталитические процессы. Он определил катализаторы как тела, присутствие которых вызывает химические процессы и без которых эти процессы происходить не могут. Сами они в ходе химических реакций остаются в неизменном виде. В 1836 г. Берцелиус писал: "У нас есть основания полагать, что в живых растениях и у животных протекают тысячи каталитических процессов между тканями и жидкостями". Однако последующие открытия поставили под сомнение такое определение фермента. В 1837 г. Т. Шванн обнаружил, что гниение, т. е. разложение веществ, по определению относящееся к процессам ферментации, вызывают микроорганизмы. Складывалось впечатление, что под термином "ферменты" понимают совершенно разные понятия: с одной стороны, невидимые, "обладающие формой", "организованные" активные начала, такие как возбудители гниения, а с другой – видимые в растворе, "не имеющие формы", "неорганизованные начала"(пепсин и диастаза). Начались дискуссии о природе ферментов. В 1680 г. нидерландский натуралист Антони ван Левенгук (1632–1723) с помощью микроскопа собственной конструкции обнаружил, что дрожжи представляют собой круглые живые "частицы", однако вплоть до начала XIX века дрожжи считали особым химическим соединением, ферментом. Примерно через 150 лет после Левенгука Шванн показал, что дрожжи действительно живые микроорганизмы, а спиртовое брожение – результат их жизнедеятельности. Это утверждение было, однако, единодушно отвергнуто выдающимися химиками того времени, такими как Йене Якоб Берцелиус, Юстус Либих и Фридрих Велер. Представление о том, что спиртовое брожение вызывается жизнедеятельностью некоего микроорганизма, получило распространение лишь после опубликования в 1857 г. работ Луи Пастера (1822–1895), благодаря которым спиртовое брожение стали связывать с жизнедеятельностью дрожжей, причем было признано, что этот процесс всегда сопровождается их ростом и размножением. Оппонируя Пастеру, Либих приводил в качестве примера действие диастазы и пепсина – "неживых субстанций", вызывающих изменения, подобные тем, которые происходят в присутствии ферментов. Он обвинял Пастера в том, что тот привлекает некую воображаемую "жизненную силу" объяснения более или менее простых химических процессов. Тем не менее в научных спорах благодаря практическим успехам микробиологии на определенное время победил принцип, выдвинутый Пастером – "нет ферментации без жизни". В результате сложилась своеобразная ситуация. Считалось, что существует два класса ферментов: организованные (истинные) ферменты, такие как дрожжи и другие микроорганизмы, и неорганизованные (растворимые) ферменты, такие как диастаза и пепсин. Согласно этим представлениям неорганизованные ферменты не связаны с процессами жизнедеятельности. Поэтому в 1876 г. на заседании Общества истории естествознания и медицины Вильгельм Фридрих Кюне (1837–1900) предложил "во избежание недоразумений и обременительных описаний... называть ферменты, не имеющие формы, или неорганизованные ферменты, которые могут действовать в организме и вне его, "энзимами". Организованные ферменты были "последним бастионом" витализма2, приверженцы которого проповедовали наличие в организмах сверхъестественной vis vitalis (жизненной силы). Господствовала точка зрения: органические соединения принципиально невозможно получить в лабораторных условиях, поскольку они обладают жизненной силой. Это представление было опровергнуто в 1828 г., когда Фридриху Велеру удалось синтезировать мочевину. В 1897 г. немецкий профессор Эдуард Бухнер (1860–1917) нанес витализму "смертельный" удар. Он пришел к выводу, что выделить находящийся в дрожжах "энзим брожения" можно чисто механическим путем, разрушая дрожжевые клетки. Первые опыты по выделению фермента путем многократного замораживания и оттаивания клеток или путем растирания дрожжей в ступке были неудачными. По предложению своего ассистента Бухнер усовершенствовал методику: в ступку с дрожжами он добавил кварцевый песок и кизельгур, тщательно растер большим пестиком, полученную массу завернул в плотную парусину и отжал на гидравлическом прессе. При этом был получен бесклеточный дрожжевой экстракт, который легко разлагался, поэтому для хранения Бухнер на ночь растворил его в концентрированном растворе сахара. В прозрачном растворе началось активное образование углекислого газа. Бухнеру удалось впервые наблюдать спиртовое брожение в отсутствии живых дрожжевых клеток в бесклеточной жидкости. Это был момент рождения современной биохимии. Месяц спустя, проведя повторные опыты, которые привели к тем же результатам, он выступил перед общественностью со своим сенсационным сообщением. Бухнер назвал открытый им фермент зимазой это был первый фермент, вызывающий образование газа. За это открытие, ознаменовавшее собой начало новой эры в развитии науки, Бухнеру в 1907 г. была присуждена Нобелевская премия в области химии. В 1897 г. он доказал, что ферментация возможна и в отсутствии живых клеток. Это открытие положило конец искусственному делению ферментов на организованные субстанции и энзимы. Организованными субстанциями оказались клетки дрожжей или других микроорганизмов. Их активность объяснялась тем, что они были "начинены" ферментами. Немецкий химик Мориц Траубе (1826–1894) уже в 1858 г. высказал предположение о том, что ферменты, вопрос о химической классификации которых еще не был решен, представляют собой белки (протеины). Однако подобные взгляды не встретили поддержки других ученых, поскольку не подкреплялись никакими доказательствами. Впоследствии было обнаружено, что подобно белкам ферменты состоят из углерода, водорода и азота, при нагревании они свертываются, под действием большинства осадителей белка выпадают в осадок и дают химические реакции, характерные для белков. Результаты этих экспериментов были встречены в научных кругах с большим скептицизмом. В 1918 г. Рихард Мартин Вильштеттер (1872–1942), лауреат Нобелевской премии, ученик Адольфа Байера и один из корифеев органической химии своего времени, вместе со студентами начал систематическую работу по выделению и очистке ферментов. Хотя при этом удалось получить очищенные ферменты, обладающие высокой активностью, однако белки в этих препаратах не были обнаружены. Поэтому Вильштеттер сделал получивший признание в научных кругах вывод о том, что ферменты – это неизвестные органические соединения небелковой природы, а белки служат носителями этих соединений. Американский биохимик Джеймс Бетчеллер Самнер в 1926 г. также проводил работы по выделению фермента в чистом виде. В качестве исходного материала он использовал бобы Сanavalia ensiformis, богатые ферментом уреазой. Уреаза катализирует разложение мочевины на углекислый газ и аммиак. Сначала Самнер измельчил бобы на кофейной мельнице и из полученной муки экстрагировал уреазу с помощью растворителя. После фильтрования экстракт был оставлен на ночь в холодном месте. На следующее утро, к великому удивлению исследователя, в фильтрате были обнаружены маленькие восьмигранные кристаллы. После перекристаллизации они разлагали мочевину в 700 раз активнее, чем исходная мука. Несмотря на скептическое отношение Вильштеттера к полученным Самнером результатам, по истечении некоторого времени научный мир поверил в силу кристаллов ферментов. Выделение фермента в виде кристаллов доказывало специфичность данного вещества. Кроме того, кристаллы уреазы проявляли типичные свойства белков. Полученные Самнером результаты были подтверждены американским биохимиком Джоном Хоуардом Нортролпом, который в 30-х годах получил в виде кристаллов пищеварительные ферменты пепсин, трипсин, химотрипсин и их неактивные предшественники. Лишь много позже стало понятно, почему в ферментных препаратах Вильштеттера не удавалось обнаружить присутствие белков: несмотря на тщательную очистку, они были настолько сильно разбавлены, что с помощью имевшихся в то время малочувствительных методов в них просто нельзя было обнаружить белок. В 1946 г. за совместную работу Самнеру и Нортролпу была присуждена Нобелевская премия в области медицины. Через 20 лет после получения первого кристаллического фермента стало очевидно, что ферменты представляют собой белки. Таким образом, ферменты, безусловно, обладают всеми свойствами белков. Они активны и стабильны лишь в определенных условиях. В физиологическом диапазоне скорость большинства ферментативных реакций, как и всех других химических реакций, с повышением температуры возрастает. Однако при более высоких температурах начинается разрушение структуры белка, происходит денатурация и, как следствие, инактивация фермента. Ферменты функционируют при нормальном давлении и, как правило, лучше всего в нейтральной среде. Однако существуют также ферменты (например, пепсин, который функционирует в желудке), для действия которых оптимальной является кислая среда. Некоторые ферменты лучше всего функционируют в щелочной среде. Но и в оптимальных условиях наблюдается "старение" ферментов: при потере активности они часто расщепляются специфическими для данной клетки протеазами, после чего необходим синтез новых молекул тех же ферментов. РАЗДЕЛ 2. КЛАССИФИКАЦИЯ ФЕРМЕНТОВ 2.1. Номенклатуры Тривиальная номенклатура. Первоначально ферментам давали названия, образуемые путем добавления окончания -аза к названию субстрата, на который данный фермент действует, например: Амилазы (от греч. amilos – крахмал) – ферменты, гидролизующие крахмал (амилон). Липазы (от греч. lipos – жир) – ферменты, гидролизующие жиры. Протеиназы (от греч. protos – главный, важный) – ферменты, гидролизующие белки (протеины). Номенклатура по типу реакции. Ферментам, катализирующим близкие по типу реакции, давали названия, указывающие тип реакции: ацилазы, декарбоксилазы, дегидрогеназы, оксидазы. Номенклатура, введенная Международным биохимическим союзом – International Union of Biochemistry (IUB). Основные принципы этой номенклатуры состоят в следующем: - ферменты называются и классифицируются в соответствии с типом и механизмом; - реакции и ферменты, которые их катализируют, подразделяются на шесть классов, в каждом из которых имеется несколько подклассов (от 4 до 18); - название фермента состоит из двух частей (первая часть -название субстрата или субстратов, вторая – тип катализируемой реакции) и оканчивается на -аза; - дополнительная информация заключается в скобки; - каждый фермент имеет кодовый номер по классификации ферментов (КФ). Первая цифра характеризует класс реакции, вторая – подкласс, третья – подподкласс, четвертая – порядковый номер фермента в его подподклассе. Например, КФ 2.7.1.1 означает, что фермент относится к классу 2 (трансфераза), подклассу 7 (перенос фосфата), подподклассу 1 (акцептором является спирт). Последняя цифра обозначает фермент гексокиназу – D-гексозо-6-фосфо-трансферазу, т. е. фермент, катализирующий перенос фосфата с АТФ к глюкозе. Классы ферментов Ферменты подразделяются на шесть классов: 1. Оксидоредуктазы (18 подклассов). 2. Трансферазы, или феразы (8 подклассов). 3. Гидролазы (11 подклассов). 4. Лиазы, или десмолазы (6–7 подклассов). 5. Изомеразы и мутазы (5–6 подклассов). 6. Лигазы, или синтетазы (5 подклассов). Оксидоредуктазы Оксидоредуктазы – ферменты, катализирующие окислительно-восстановительные реакции с участием двух субстратов: Sвосст + S'окисл = Sокисл + S'восст Ферменты катализируют реакции, в которых участвуют такие группы, как СН–ОН, СН–СН, С=О, СН–NH2, –СН–NН–. В клетке окислительные процессы происходят по нескольким механизмам: 1. По типу отнятия электронов: An+ электроны Am+ 2. По типу отнятия водорода: А1 –2Н А2 3. Путем присоединения к субстрату кислорода: А1 + О2 А2 Оксидоредуктазы подразделяют на дегидрогеназы, оксидазы, оксигеназы. Кроме того, в митохондриях клеток содержится группа ферментов – промежуточных переносчиков электронов дыхательной цепи. Дегидрогеназы – это ферменты, отнимающие водород от одних органических веществ и передающие другим органическим соединениям (анаэробные дегидрогеназы) или кислороду воздуха (аэробные дегидрогеназы). Анаэробные дегидрогеназы содержат коферменты НАД (козимаза), НАДФ, аэробные – ФАД. Оксигеназы – это ферменты, осуществляющие включение одного (оксигеназы) или двух (диоксигеназы) атомов кислорода в молекулу субстрата. К ним относятся ферменты, осуществляющие окисление путем передачи восстановительного эквивалента от субстрата либо на молекулярный кислород, либо на кислород пероксида водорода или органических перекисей. К оксидазам относятся пероксидазы и полифенолоксидазы. Пероксидазы – ферменты, окисляющие субстрат при помощи пероксида водорода: Н2О2 + АН2 → А + 2 Н2О2, где АН2, А – восстановленный и окисленный субстраты соответственно Субстратами пероксидаз служат фенолы и ароматические соединения. Пероксидазы – железосодержащие ферменты, гемом которых является феррипротопорфирин IX. Окисление субстратов осуществляется по одноэлектронному механизму. Первой стадией каталитического процесса является образование комплекса между железом фермента и пероксидом водорода. Следовательно, окисление субстрата осуществляется пероксидом водорода, который активирован ферментом: Е-Н2О + Н2О2 → Е- Н2О2 + Н2О Е- Н2О2 + АН2 → Соединение 2 + АН• Соединение 2 + АН• → Е-Н2О + А Пероксидазы широко распространены в растительных тканях, они находятся в клеточной стенке и пероксисомах. Известно более 20 изоформ пероксидаз с различной активностью. Роль пероксидаз в биохимии и физиологии растений окончательно не выяснена. Пероксидазы наряду с каталазой препятствуют накоплению пероксида водорода в клетке, выполняют защитную функцию, играют важную роль в онтогенезе растений при патогенезе, противостоянии стрессу, различных механических повреждениях. Они участвуют в нейтрализации продуктов вторичного обмена (фенолов), в регуляции гормонального статуса растений через окисление индолилуксусной кислоты, образование этилена из метионина, участвуют в процессах синтеза лигнина в клеточной стенке. Образованные в пероксидазных реакциях активные формы кислорода могут использоваться растениями для защиты от патогенеза. Пероксидазы могут разрушать комплексы, содержащие радионуклеиды, препятствовать их накоплению. Анализ ферментативной активности пероксидаз проводится фотоколориметрическим методом при длине волны 440 нм и рабочей длине кюветы 2 см. При окислении фенола, бензидина, гваякола, катехола и других фенольных соеди-нений определение активности пероксидазы основано на образовании красно-коричневых продуктов. Общая схема реакции пероксидаза Фенол + Н2О2 Хинон + Н2О красно-коричневая окраска Полифенолоксидаза – оксидоредуктаза, катализирующая окисление полифенолов. Определение ее активности проводится фотоколориметрическим методом при длине волны 590 нм, рабочей длине кюветы 2 см, при воздействии на систему пирокатехин-p-фенилендиамин. Реакция протекает следующим образом: Полифенолоксидаза содержится в высших растениях и грибах. Массовая доля меди в данном ферменте составляет 0,2–0,3 %. Молекулярная масса полифенолоксидазы у грибов равна 34 500, у чайного листа – 144 000. Она участвует в окислении полифенолов и дубильных веществ, ее действием объясняется потемнение плодов и овощей при сушке, а также поверхностей разрезанных яблок или картофельных клубней. К оксидоредуктаза м относятся также ферменты дыхательной цепи цитохромы. Каталаза – фермент, катализирующий расщепление Н2О2 относится к классу оксидоредуктаз. Биологическая роль каталазы заключается в том, что она разрушает токсичную для животных и растительных клеток Н2О2, которая накапливается как рабочий продукт метаболизма: каталаза 2Н2О2 2Н2О + О2 Каталаза – двухкомпонентный фермент, состоящий из белкя и простетической группы, которая содержит гематин и связывается с белком двумя карбоксилами. Каталаза локализуется в пероксисомах. Это быстродействующий фермент, при 0 °С одна молекула каталазы разлагает до 40 000 молекул Н2О2 в секунду. Каталаза ингибируется синильной кислотой Трансферазы Трансферазы – ферменты, катализирующие перенос группы от субстрата S к субстрату S': S – G + S' → S' – G + S Ацилтрансферазы – ферменты, переносящие ацильные группы R–СО– (например, ацетил СН3СО–): Ацетил-СоА + Холин → СоА + Ацетилхолин Алкилтрансферазы – ферменты, переносящие алкильные группы (например, метилтрансферазы переносят СН3–). Фосфотрансферазы – ферменты, переносящие группы, содержащие фосфор. Гликозилтрансферазы – ферменты, катализирующие перенос остатков моносахаридов. К ним относятся фосфорилазы. Представителем фосфорилаз является крахмальная фосфорилаза (α-глюкан-фосфорилаза, КФ2.4.1.1). Гидролазы Гидролазы – это ферменты, катализирующие процессы гидролиза (гидролиз эфирных, сложноэфирных, пептидных и гликозильных связей, кислотных ангидридов, связей С–С, С–галоида, Р–N). Гидролазы подразделяются на эстеразы, карбогидразы, протеазы, амидазы, дезаминазы, фосфорилазы и др. Эстеразы – ферменты, катализирующие реакции расщепления и синтеза сложных эфиров: эстеразы R–СО–О–R1 + Н2О R–СООН + R,ОН К ним относятся липазы, танназы, хлорофиллазы, пектинэстера-зы (пектазы), фосфатазы, сульфатазы. Липазами (КФ 3.1.1.3) называются эстеразы, катализирующие гидролиз и синтез жиров: Танназы – ферменты, катализирующие гидролиз сложного эфира таннина. Хлорофиллазы – это эстеразы, катализирующие переэтерификацию хлорофилла. Пектазы катализируют гидролиз эфиров пектина. фосфатазы ускоряют расщепление и синтез сложных эфиров, образованных спиртами и фосфорной кислотой. Они подразделяются на фосфатазы неспецифического и специфического действия. Неспецифические фосфатазы катализируют отщепление Н3РО4 от фосфорных эфиров, для них характерен широкий диапазон рН (4,5-9,0). К ним относятся рибонуклеаза и дезоксирибонуклеаза, катализирующие распад рибонуклеиновой и дезоксирнбонуклеиновой кислот. Специфические фосфатазы действуют на фосфорные эфиры определенного состава. К ним относится фруктозодифосфатаза, действующая только на фруктозодифосфорную кислоту. Сульфатазы катализируют гидролиз и синтез сложных эфиров серной кислоты. К карбогидразам относятся ферменты, катализирующие гидролиз и синтез гликозидов, олиго- и полисахаридов. Карбогидразы подразделяются на олигазы и полиазы. Полиазы — ферменты, катализирующие гидролиз полисахаридов, а олигазы — гидролиз олигосахаридов. Олигазы К олигазам относятся α-глюкозидаза, (3-глюкозидаза, α-галактозидаза, β-галактозидаза, β-фруктофуранозидаза. α-Глюкозидаза, или мальтаза – фермент, расщепляющий α -глюкозидную связь в дисахаридах и глюкозидах. Биологическим субстратом для данного фермента являются мальтоза и сахароза. Содержится в тканях растений, плесневых грибах, дрожжах, бактериях, проросшем просяном зерне. Просяной солод применяют как добавку к ячменному солоду при изготовлении мальтозной патоки, так как он богат активной мальтазой. β-Глюкозидаза – фермент, расщепляющий β-глюкозидную связь в ди- и полисахаридах, β-глюкозидах (глюкозиды – амигдалин, арбутин) α-Галактозидаза – фермент, катализирующий гидролиз α-галактозидов, например рафинозы и мелибиозы. Этот фермент содержится в пивных дрожжах и грибном солоде, например в такадиастазе -ферментном препарате, полученном из плесневых грибов. β-Галактозидаза (КФ 3.2.1.23), или лактаза, – фермент, катализирующий гидролиз лактозы на глюкозу и галактозу; содержится в бактериях, плесневых грибах, плодах миндаля, в лактозных дрожжах, в молочных железах животного организма. β-фруктофуранозидаза (КФ 3.2.1.26), или сахараза, или инвертаза, – фермент, катализирующий расщепление сахарозы на глюкозу и фруктозу. α-Глюкозидаза гидролизует сахарозу у α-глюкозидного С-атома остатка глюкозы, а β-фруктофуранозидаза гидролизует связь у β-глюкозидного С-атома остатка фруктозы. β-фруктофуранозидаза (сахараза) также гидролизирует рафинозы (триозы) с образованием молекулы фруктозы и молекулы дисахарида мелибиозы. Полиазы Одной из полиаз является амилаза, которую называют также птиалином, или диастазой. Амилаза была открыта в 1814 г. К.С. Кирхгофом. Содержится в слюне, панкреатическом соке, плесневых грибах, проросшем зерне; гидролизует крахмал до декстринов и мальтозы. Амилазы гидролизуют крахмальные зерна и крахмальный клейстер. Установлено существование трех амилаз: α-амилазы, β-амилазы и γ-амилазы (глюкоамилазы). α-Амилаза (КФ 3.2.1.1) (другие названия птиалин, декстриногеноамилаза, гликогеназа) – содержится в слюне, в проросших зернах пшеницы, ржи, ячменя. β-Амилаза (КФ 3.2.1.2.), или сахарогеноамилаза, содержится в зернах пшеницы, ржи, ячменя, соевых бобах. α- и β-Амилазы различаются по характеру действия на компоненты крахмала – амилозу и амилопектин. β-Амилаза расщепляет амилозу на 100 % до мальтозы, амилопектин – на 54 % до мальтозы и на 46 % – до декстринов, дающих с йодом красно-коричневое окрашивание. Данные декстрины гидролизуются α-амилазой до декстринов с меньшей молекулярной массой, не дающих окрашивания с йодом, с образованием незначительного количества мальтозы. Декстрины, образовавшиеся при действии β-амилазы на амилопектин гидролизуются α-амилазой с образованием декстринов, обладающих меньшей молекулярной массой и дающих окрашивание с йодом. Пои последующем длительном действии α-амилазы на крахмал 85% его превращается в мальтозу. Таким образом, при действии на крахмал β-амилазы образуется в основном мальтоза и незначительное количество высокомолекулярных декстринов. При действии на крахмал α-амилазы образуются в основном декстрины меньшей молекулярной массы и незначительное количество мальтозы. Оптимум рН β-амилазы – 4, α-амилазы – 5,5. Так как активность α-амилазы снижается при повышении кислотности, тесто из муки, полученной из проросшего зерна, замешивают на жидких дрожжах (молочнокислых заквасках); молочная кислота угнетает действие α-амилазы. α-Амилаза более устойчива к действию повышенных температур, ее температурный оптимум (68 °С) выше температурного оптимума β-амилазы (52 °С). Семена растений отличаются содержанием α- и β-амилазы. Так, β-амилаза содержится в непроросших семенах пшеницы, ржи и ячменя, α-амилаза образуется лишь при прорастании. В непроросших и проросших соевых бобах присутствует только β-амилаза. В непроросших семенах сорго содержится α-амилаза. Инактиваторы амилазы – белки и дубильные вещества – служат регулирующим фактором в прорастающем и созревающем зерне. Солод, применяемый при изготовлении пива и осахаривании картофельных или мучных заторов в спиртовой промышленности, является источником активной амилазы, превращающей крахмал в сбраживаемый сахар – мальтозу. Активный грибной солод получают из плесневых грибов. Глюкоамилаза (КФ 3.2.1.3) – фермент, гидролизующий крахмал с образованием глюкозы и небольшого количества декстринов. Получают из плесневых грибов и используют для производства кристаллической глюкозы и глюкозной патоки. Целлюлоза – комплекс двух ферментов: эндоглюканазы (КФ 3.2.1.4) и экзоглюканазы (КФ 3.2.1.74). Гидролизует клетчатку с образованием целлобиозы. Целлюлаза содержится в проросшем зерне, бактериях и плесневых грибах, является активным ферментом в грибах-вредителях, живущих на древесине. Бактерии, живущие в желудках травоядных животных, выделяют активную целлюлазу, которая гидролизует клетчатку. Этим объясняется способность животных переваривать и усваивать клетчатку. Инулиназа (КФ 3.2.1.7), или инулаза, – фермент, гидролизующий инулин с образованием фруктозы. Обнаружена в высших растениях, содержащих большое количество инулина, и плесневых грибах. Гемицеллюлазы – группа ферментов, гидролизующих различные гемицеллюлозы. Последние содержатся в прорастающих семенах и плесневых грибах. Например, ксиланаза (КФ 3.2.1.32) гидролизует ксиланы до ксилозы. Тротопектиназа и Полигалактуроназа (пектиназа) – ферменты, расщепляющие пектиновые вещества. Протопектиназа – фермент разрушающий связи между метоксилированной полигалактуроновои кислотой и арабаном или галактаном. Эта кислота (растворимый пектин) гидролизуется пектинэстеразой до метилового спирта и полигалактуроновои кислоты. Полигалактуроназа катализирует гидролиз полигалактуроновои кислоты. Полигалактуроназа характерна для бактерий и плесневых грибов, в высших растениях встречается редко (пока обнаружена только в плодах томатов). Плесневые грибы используются для получения препаратов данных ферментов, которые применяются в пищевой промышленности для осветления фруктовых соков, плодовых и виноградных вин, содержащих большое количество растворимого пектина. Протеазы (протеолитические ферменты) – это ферменты, катализирующие гидролиз белков, полипептидов, олигопептидов. Подразделяются на протеиназы (полипептидазы) и пептидазы. Протеиназы (полипептидазы) осуществляют гидролиз белков и высокомолекулярных полипептидов. Пептидазы расщепляют низкомолекулярные пептиды (тетра-, три- и дипептиды). По воздействию на конкретные участки пептидной цепи протеолитические ферменты делятся на эндопептидазы (действуют на участки цепи, расположенные далеко от ее концов) и экзопептидазы (отщепляют концевые аминокислоты). Примерами экзопептидаз являются кар-бокси- и аминопептидазы. В зависимости от строения активного центра протеолитических ферментов выделяют следующие протеиназы: - сериновые, содержащие в активном центре серии (трипсин, химотрипсин); - тиоловые, содержащие в активном центре цистеин (катепсин В), - кислые, содержащие в активном центре две –СООН-группы (пепсин, катепсин Д). Протеолитические ферменты подразделяются на ферменты желудочно-кишечного тракта, тканевые и бактериальные. Пезамидазы (амидазы) – гидролазы, катализирующие процессы дезминирования амидов кислот с образованием NH3 и кислоты. К амидазам относятся аргиназа, уреаза, аспарагиназа, глутаминаза. Аргиназа – фермент печени, катализирует гидролиз аргинина с образованием мочевины и орнитина. Уреаза - фермент, катализирующий гидролиз мочевины с образованием NH3 и СО2. Аспарагиназа дезаминирует аспарагин, глутаминаза – глутамин. Дезаминазы катализируют процессы дезаминирования азотистых оснований (аденин, гуанин) с образованием спиртов и аммиака. Гуаназа и аденилаза катализируют дезаминирование гуанина и адениловой кислоты. В растительной клетке гидролитические ферменты локализованы в вакуолях, отделенных от цитоплазмы белково-липидной мембраной – тонопластом. Лиазы Лиазы (десмолазы) – ферменты, отщепляющие группы от субстратов по негидролитическому механизму с образованием двойных связей. К лиазам относятся ферменты, действующие на связи С–С, С–О, С–N, С–S, С–галоид (альдолаза, декарбоксилаза). Представителем лиаз является фермент рибулозодифосфаткарбоксилаза (4.1.1.39), играющий важнейшую роль в процессе фотосинтеза: Молекула рибулозодифосфаткарбоксилазы включает 16 субъединиц: восемь больших, образующих активный центр, синтезируются в хлоропласте, восемь малых – синтезируются в цитоплазме, транспортируются через мембрану хлоропласта и соединяются с большими субъединицами. Молекулярная масса фермента, выделенного из листьев шпината, равна 550 000. Содержание рибулозодифосфаткарбоксилазы составляет в среднем 16 % от общей массы белка в листьях. Изомеразы и мутазы Изомеразы – ферменты, катализирующие взаимопревращения оптических, геометрических и позиционных изомеров. Мутазы обеспечивают внутримолекулярный перенос атомных группировок без образования изомера. К изомеразам относятся цис-транс-изомеразы, например: ретинальизомераза Транс-ретиналь————————> 11-цис-ретиналь Подклассом изомераз являются изомеразы, катализирующие взаимопревращения альдоз и кетоз. Лигазы Лигазы (от лат. ligare – связывать), или синтетазы, – ферменты, катализирующие соединение двух молекул, сопряженное с разрывом пирофосфатной связи АТФ. К данному классу относятся ферменты, катализирующие реакции, в ходе которых образуются связи С–О, С–S, С–N, С–С. |